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医師の学びをAIがアップデート - PubMed論文を3分動画に自動変換
PubMedのAPIを使用して、検索したりメタデータを取得したりする
NCBIのAPI経由でPubMedから症例報告を取得する
Alpaca-LoRAをPubMedQAでファインチューニングしてみる
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Google Driveからのファイル読み込みをやめるとColabでの学習を速くできるかも
NLP
DeepLearning
GoogleDrive
PyTorch
GoogleColaboratory
【論文紹介】HyperGCN: A New Method of Training Graph Convolutional Networks on Hypergraphs
Network
GNN
Biopython Tutorial and Cookbook和訳(4.5)
Python
チュートリアル
bioinformatics
Biopython
バイオインフォマティクス
[Kaggle]PANDAコンペ参加記
Python
機械学習
Kaggle
【論文紹介】CURVATURE GRAPH NETWORK : 曲率グラフネットワーク
Network
グラフ
[論文読み] GRAPH-BERT: Only Attention is Needed for Learning Graph Representations
機械学習
DeepLearning
論文読み
興味のある論文が公開・投稿されたら通知が届くようにする
pubmed
email
ncbi
bioRxiv
JuicerでHi-Cのコンタクトマップをつくりたい
genome
ShellScript: 特定のwebサイトから必要な情報を抜きし，過去の結果を比較し差分をとりだす．
ShellScript
Zsh
スクレイピング
AppleScript
Pubmedの.xmlデータをpythonで処理する[その2]
Python
XML
pubmed
COVID-19関連の論文の可視化（BERT→UMAP→plotly）
plotly
huggingface
COVID-19
Pubmedの.xmlデータをpythonで処理する
Python
XML
pubmed
Googleの医学研究（ディープラーニングによる網膜眼底画像からの貧血検出）
機械学習
DeepLearning
AI
人工知能
医療
【随時更新】[化学]科学情報と開発（メモ）
開発
化学
代謝物データから意味を抽出するMSEA、ツールであるMetaboAnalystとMetaboAnalystRの紹介
R
bioinformatics
Metaboanalyst
MetaboAnalystR
Flybase上の遺伝子情報ページに素早くアクセスするAlfred workflow/Albert extension
Mac
Linux
生物学
PubMedで定期的に検索したい論文情報をCSVデータとして蓄積させていくスクリプトの作成
pubmed
Python3
投資家IPランドスケープ・スタートアップ支援IPランドスケープ・大学支援用に改良中 更新中）tfidf etc embeddings cluster reconstructing vis: 特許など長文の、動的な文章間類似俯瞰図可視化・迅速閲覧・解析・探索手段。および第三の特許検索手法、動的な知識抽出管理手法、特許自動生成 （類似度ベクトルと小規模言語モデル及びChatGPTを用いた空白領域における特許生成追加）
自然言語処理
NLP
可視化
Visualization
特許
ゲノム編集系のバイオインフォマティクス
bioinformatics
ngs
ゲノム編集
Genomeediting
CRISPR
PubMed APIの概要、データ取得、シンプルなEDA、及びクラスタリング(Python)
Python
pubmed
EDA
タグ一覧(ランキング順)【直近１年間/上位25,000タグ】【2021/1 更新停止】
Qiita
QiitaAPI
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タグ一覧(アルファベット順)【直近１年間/上位25,000タグ】【2021/1 更新停止】
Qiita
QiitaAPI
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「量子(14)アニーリングの基礎」を読む 第１日
巡回セールスマン問題
イジングモデル
量子アニーリングの基礎
西森秀稔
スピングラス
Ensemblが返すNCBI Gene IDが一意じゃなかった件について
R
バイオインフォマティクス
「量子(68)アニーリングの基礎」の参考文献の参考文献
量子コンピュータ
参考文献
量子計算機
量子アニーリングの基礎
西森秀稔
「量子(13)アニーリングの基礎」を読む
量子コンピュータ
量子アニーリング
イジングモデル
量子計算機
T-QARD
Qiitaのタグ一覧(アルファベット順)
Qiita
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タグ説明
初投稿と練習
初投稿
メラノーマガイドラインパブリックコメントにIT関係者からの意見を出す準備 色(33)
用語
略号
小川メソッド
医工連携
QiitaEngineerFesta2023
【R】Mygene.infoで遺伝子情報を取得（改）
R
Bioconductor
bioinformatics
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