Zennta

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お手軽NEB計算 RDKitで分子組み立て
RDKit database cartridgeを用いた化合物データベースのORMとしてSQLModelを使用する方法
RDkit+Psi4で量子計算+可視化
【RDKit】MolsToGridImage()で複数行のlegendを大きく表示する
RDKitで拘束を入れて構造最適化をする
RDKitの3次元座標を使いこなす(移動&回転)
rdkitで原子電荷の取得と構造式とともに表示する方法
rdkitでsmilesから構成原子のpython辞書を作成する
rdkitで芳香族性などについて
rdkitで光学異性体の判定や近傍原子のCIPランクなどについて
RDKit: 空白のmolオブジェクトを返す
RDKitで作った分子から各元素の数を取り出して燃やしてみる
Google ColaboratoryにminiforgeをインストールしてRDkitを走らせた
RDKit:PandasのDataFrameのSMILES列にapplyを適用してcanonicalizeする
RDKit:canonical SMILESを比較する
[CustardKit] しっぽり明朝の濁点付き仮名を簡単に入力できるiOS用のキーボードを作る
RDkitを用いた分子構造生成2(A-B-C型)
RDkitを用いた分子操作(分子のフラグメント化)
RDkitを用いた分子構造生成1(A-B型)
RDkitを用いた3D構造の最適化
RDkitを用いた分子の骨格変換
RDkitを用いた分子構造の描画
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    化合物の特徴量抽出 RDkitを用いたフィンガープリントについて
    Python
    RDKit
    chemoinformatics
    化学
    ケモインフォマティクス
    化学系データサイエンティスト駆け出しのおすすめURL
    Python
    初心者
    データサイエンス
    pybelがテキトウすぎてやばい話
    RDKit
    python2.7
    OpenBabel
    raziのDocker-composeで創薬レイドバトル2018用のJupyter Notebookからアクセスできる化合物データベースを作った話
    PostgreSQL
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    RDKit
    Jupyter
    docker-compose
    タンパク質モデリングソフトウェアパッケージRosetta 3.12のインストール方法 for macOS, Linux
    bioinformatics
    Rosetta
    PythonとRDKitをソースビルドするDockerfileを作った
    Python
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    SMILES記法の化合物のMACCS keysを求める
    Python
    メモ
    初心者
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    chemoinformatics
    化合物データの読み込みのトラブルシュート
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    chemoinformatics
    化合物をベクトルにして比較しプロットする
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    chemoinformatics
    Django + RDKit database cartridge のDocker-composeで化合物データベースを作った話
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    化合物データの取り扱いのイロハ
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    sqlalchemyで取り出したレコードをjoblibの引数にすると出るエラーへの対処
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    CentOS6.9にAnacondaを使ってOpenBabel 2.4.1をインストールする時にlibstdc++ライブラリが古くて起きたエラーへの対処
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    OSXでRDKitをソースからビルドするときに出るboost関係のエラーをなんとかする
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    Awesome Python:素晴らしい Python フレームワーク・ライブラリ・ソフトウェア・リソースの数々
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    医薬品設計とニューラルネットワーク
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    RDKitをc++で動かす ~git cloneからHello methaneまで~
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