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Gaussian25 と GaussView7
Gaussian
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AlphaFold3 を Fedora40 にインストール
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openbabel のMac/Linuxへのインストール方法
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Psi4/AmberToolsで作成したトポロジーファイルをつかいMDシミュレーション
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【備忘録】SDFファイルへの変換
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Psi4/AmberToolsで非天然アミノ酸のトポロジーファイルを作成
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【Linux】最新版のOpenBabelをローカルにインストールする
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DatabricksでOpen Babelを使う
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RDKitやPsi4をインストールするDockerfileを作った
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分子構造と結晶構造の探し方
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DNAやタンパク質の立体構造をRubyで表示すっゾ - GR.rbの場合
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bioinformatics
OpenBabelを使ってSMILES表記の分子式から3次元の分子構造を復元する方法
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OpenBabelの最新版をソースコードからコンパイルしてインストールする方法
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【随時更新】[化学]科学情報と開発（メモ）
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Open Babelでmol2形式をpdb形式に変換すると警告が出る
OpenBabel
タグ一覧(ランキング順)【直近１年間/上位25,000タグ】【2021/1 更新停止】
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PyMOLで量子化学計算ソフトGaussianのcubeファイルを開いて分子軌道を表示する方法
bioinformatics
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有機化合物の分子構造図 を書けるプログラムchemtoolを使えるようになるまで
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pybelがテキトウすぎてやばい話
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raziのDocker-composeで創薬レイドバトル2018用のJupyter Notebookからアクセスできる化合物データベースを作った話
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Ubuntu 16.04にAvogadro1.2.0をインストールする
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CentOS6.9にAnacondaを使ってOpenBabel 2.4.1をインストールする時にlibstdc++ライブラリが古くて起きたエラーへの対処
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化合物の2次元構造から体積を算出する
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