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snp distance matrixを系統樹のラベル順に並び替える

ggtreeで描図した系統樹のラベルを上から順に取得しファイルに書き出す(get the tree order using ggtree)

大系統樹から任意の種で構成された部分系統樹を抜き出す

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系統樹OTU名のリネーム処理

c安全分析における HAZOP による想定外の洗い出し

Plateauで身近な地域の地図建物情報をUnityにとりこみ、簡易ドローンシュミレーターを作ってみた

ドローンシュミレーター

シングルセルデータからPalantirで細胞運命の解析をやってみた

singlecellRNAseq

AIの女の子がわいわい競馬予想するシステムを個人展示したら倍率2000倍の馬券が当たってしまった (3)キャラ実装編･上

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技術士(27)の方の書かれた本 1000冊 Researchmap(37)

PythonとLLMで作る！カレー好きのための知識グラフQAシステム

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MAFFT - TrimAl - RAxML-NG - FigTree を使って分子系統樹を作る

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GTDBの系統樹からphylumを抽出し、iTOLで表示する

GTDBで提供されている系統樹をiTOLで開く

バイオインフォマティクス

WSL2上のUbuntuでETE Toolkitの環境を構築する

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ソフトウェア産業と他分野の比較

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Bioinformatics command チートシート [備忘録]

大規模言語モデルの基礎

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ChatGPTとPythonで学ぶ階層的クラスタリング

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ジョジョを知っている日本語大規模言語モデル！ japanese-stablelm-base-alpha-7b

モチーフ検索による酵素の論理的探索をしたい

大規模言語モデル(LLM)とそれまでの技術の流れを入門用にまとめた

自然言語処理

データ分析

BiopythonとGenBankファイル形式の基礎

応用情報技術者試験　ストラテジ分野　用語まとめ

応用情報技術者試験

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医学論文機械翻訳例（１）TIF1γ

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OrthoFinder2で検出したsingle-copy orthologsのFASTAエントリを一括改名する

円形データ可視化パッケージ「pyCirclize」を開発してみた話

データサイエンス

トランスポゾン解析その1

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