Zennta
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【Ensemble】Ranking Explanation
【ML】Ensemble Method indtorduction
Triton - Ensemble Modelsのオーバーヘッドの調査
論文要約：Stacking Ensemble Learning in Deep Domain Adaptation for Ophthalm
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BiocondaでRNA-seq解析をやってみる
bioinformatics
ngs
RNA-seq
bioconda
バイオインフォマティクス
edgeR packageで発現変動遺伝子を抽出する
R
RNA-seq
edgeR
RでEnsembl gene IDからEntrez Gene ID (NCBI Gene ID)に変換する
R
Bioconductor
bioinformatics
scRNA-seqデータの再解析記録 (MARS-seq)(未)
R
bioinformatics
scRNA-seq
MARS-seq
遺伝子のID変換のためのwebツール
バイオインフォマティクス
遺伝子解析
言語処理100本ノック-74(scikit-learn使用):予測
Python
NLP
ロジスティック回帰
言語処理100本ノック
tf-idf
ensembl API を呼び出す CLI を Rust で書いた/ ツールを Rust で書く意味
Rust
CLI
bioinformatics
NextflowからCWLで書かれたワークフローを呼び出す
bioinformatics
RNA-seq
cwl
nextflow
2295の生物種のアノテーションを扱うAnnotationHubパッケージ
R
Bioconductor
bioinformatics
rentrezでNCBI Geneの情報を取得
R
バイオインフォマティクス
Ensemblが返すNCBI Gene IDが一意じゃなかった件について
R
バイオインフォマティクス
各国のEnsemblサーバーの通信状態を確認
R
バイオインフォマティクス
癌細胞データベース（CCLE）の癌種分類(2)
Python
bioinformatics
Jupyter
癌細胞データベース（CCLE）の癌種分類(1)
Python
bioinformatics
Jupyter
RNA-seq 発現変動遺伝子解析：salmonとTCC-GUIを使って
Python
R
bioinformatics
RNA-seq
TCC-GUI
【R】Mygene.infoで遺伝子情報を取得（改）
R
Bioconductor
bioinformatics
ゲノムの任意の位置の塩基配列を取得したい
samtools
ヒト変異のHGVS表記の変換(vep api)
Python
vep
変異の影響をお手軽に確認したい
vep
変異のHGVS表記の変換(Python hgvs)
Docker
Python3
hgvs
変異のHGVS表記の相互変換(Ensembl variant_recoder)
Docker
ensembl
variant_recoder
TCGAデータを用いた発現情報リストの作成
R
TCGA
TCGA(GDC-DP)からの原始的なデータ取得(2023/2/22 追記)
R
GDC
Client
TCGA
RNA-seqのゲノムインデックスとアノテーションファイルを作成（Bowtie2）
bowtie2
index
annotation
RNA-seq
ensenbl
Ruby から BioMart を使ってみる
Ruby
bioinformatics
biomart
「DNAと遺伝情報の物理」伏見譲。統計(20) 量子(77)
Python
DNA
量子
遺伝子解析
CountdownCalendar2022
UCSCとEnsemblとNCBIで染色体名（Chromosome name）を比較する（GRCh38/hg38）
bioinformatics
【R】mygeneパッケージで遺伝子の情報を取得する
R
Bioconductor
bioinformatics
Bio::Perlを使いこなせずに挫折した話
Perl
bioinformatics
bioperl
ncbi
blast
遺伝子発現データを使用した機械学習
Python
MachineLearning
bioinformatics
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