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【Ensemble】Ranking Explanation
【ML】Ensemble Method indtorduction
Triton - Ensemble Modelsのオーバーヘッドの調査
論文要約：Stacking Ensemble Learning in Deep Domain Adaptation for Ophthalm
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【Scanpy】シングルセル解析・アノテーション（Celltypist / decoupler）
annotation
scanpy
シングルセル解析
Shortread RNA-Seqのためのリファレンスゲノムの取得方法
@linux
@Ubuntu
@RNA-Seq
Google Colab で Bioconductor
R
Bioconductor
RPy2
colaboratory
ChatGPT
なんちゃってバイオインフォマティクス
Python
#バイオインフォマティクス
#ensembl
#Homo_sapiens
#DNA
purrr::map()を活用した多条件bulk-RNA-Seq解析の実行
R
bioinformatics
RNA-seq
Transcriptごとに各領域のGC含量とG/C ending codonの割合を算出したい
R
bioinformatics
バイオインフォマティクス
遺伝子ごとにUTR長やGC含量を取得する方法
R
bioinformatics
バイオインフォマティクス
遺伝子情報をDB横断的に検索するPythonパッケージ "gget"
Python
bioinformatics
円形データ可視化パッケージ「pyCirclize」を開発してみた話
Python
matplotlib
bioinformatics
データサイエンス
個人開発
【TBtools】シークエンスデータのシンテニープロットやってみた
バイオインフォマティクス
染色体
ゲノム解析
TBtools
【バイオインフォマティクス】NGS解析に使用するリファレンスゲノムの取得方法について
Python
R
bioinformatics
RNA-seq
ensembl
【初心者向け】GFF(GTF)とゲノムFASTAがあれば出来る事"GFFREAD"
バイオインフォマティクス
GVFとVCFを編集する
bioinformatics
ngs
BioconductorのAnnotationDbiパッケージの中身のsqliteデータベース取り出してをRubyなど他の言語で利用することを考える
Ruby
SQLite3
Sequel
Bioconductor
bioinformatics
GvizでCRPの周囲のゲノムブラウザの図を描いてみる
R
Bioconductor
bioinformatics
gviz
遺伝子名からensembl gene IDにRで一括変換
R
MacOSX
biomart
ensembl
生物系データベースの活用事例
DB
example
Howto
ChIPseekerでゲノムの位置情報にアノテーションをつける
R
bioinformatics
ChIPseeker
RNA-Seqの一連の流れ（生データからエンリッチメント解析まで）
RNA-seq
bioDBnet db2db on Savon
Ruby
SOAP
savon
JavaScript製のJSON用テンプレートエンジンの比較
JavaScript
Node.js
JSON
template
WSLにEnsembl Variant Effect Predictor (VEP) をインストールしてみた
bioinformatics
Variant
WSL
vep
Mutation Surveyorを使わずに無料でヘテロ接合Indelを解析したい
Bioconductor
bioinformatics
CRISPR
次世代シーケンサーのデータをRubyで操作するライブラリを作りたい話 ruby-htslib
Ruby
bioinformatics
samtools
htslib
biomaRt, getBM で "Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote,..." というエラーが出る問題
R
bioinformatics
バイオインフォマティクス
biomart
gtfファイルの取り扱い
Python
pandas
Ensembl Bacteriaゲノムブラウザで細菌のゲノムを見る
bioinformatics
genome
細菌種が任意の遺伝子を持っているかKEGGで確認する
bioinformatics
バイオインフォ備忘録 | 配列データの取得から相同性検索まで
bioinformatics
ensembl
genbankファイルをgffファイルに変換する
Python
Python3
bioinformatics
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