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遺伝研サーバーにおけるローカルへのRインストール
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ローカルアライメントで16SrRNA 塩基配列をトリミングする
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2024/10/24主にITとかセキュリティの記事
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snRNA-seqを使った実験の論文を読んでデータ解析してみた
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遺伝研スパコンでANIを使う
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遺伝研のスパコンでminiconda3のbaseとenvのパスがシステム側になってしまったときの修正法
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[Biopython]細菌ゲノムの簡単なstatistics (ID、ゲノムサイズ、遺伝子数など) を出力する
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BigQueryを使ってNCBI SRAの配列データからウイルスゲノムを釣り上げよう
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[Biopython] NCBI RefSeqの真核生物ゲノムから各遺伝子１本ずつタンパク質を取り出す
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2022年度PAGS・DDBJ合同 中級者情報解析講習会の感想
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DDBJの提供する微生物ゲノム遺伝子アノテーションツール, DFASTをGoogle Colaboratoryで利用する
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遺伝研スパコンを使ってTrinityを動かしde novo assembly
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PythonによるRNA-Seq（バルク）データ解析 ~低発現遺伝子の除外・Log2倍率変化 (Fold change)の計算・統計計算 (Student's t, Benjamini-Hochberg)~
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生物系データベースの活用事例
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AlphaFold (ver.2.3.2) インストール
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遺伝研スパコンでDFASTを動かす
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Singularityでdefファイルをリモートでビルドする方法 （MacOS向け）
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DDBJのスパコンでGuppyを使ってbasecallしたい
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